Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtskP55097 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtskP55097 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtskP55097 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtskP55097 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtskP55097 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtskP55097 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtskP55097 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtskP55097 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtskP55097 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtskP55097 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CtskP55097 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms