Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ephb3P54754 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ephb3P54754 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms