Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CnbpP53996 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CnbpP53996 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CnbpP53996 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CnbpP53996 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms