Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PctpP53808 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PctpP53808 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PctpP53808 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PctpP53808 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PctpP53808 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PctpP53808 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PctpP53808 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PctpP53808 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PctpP53808 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PctpP53808 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PctpP53808 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PctpP53808 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms