Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2e3P52483 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2e3P52483 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms