Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pold1P52431 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pold1P52431 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms