Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc4P51655 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms