Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RoraP51448 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RoraP51448 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RoraP51448 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RoraP51448 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RoraP51448 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RoraP51448 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RoraP51448 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RoraP51448 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms