Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LtbrP50284 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LtbrP50284 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms