Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc13P50207 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc13P50207 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc13P50207 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc13P50207 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc13P50207 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc13P50207 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc13P50207 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms