Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtpreP49446 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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