Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atoh1P48985 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atoh1P48985 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms