Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni3P48787 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms