Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrprbP47758 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrprbP47758 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms