Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf4P43488 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsf4P43488 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms