Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmx3P42581 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmx3P42581 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms