Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pik3caP42337 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pik3caP42337 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pik3caP42337 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms