Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig1P37913 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig1P37913 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lig1P37913 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lig1P37913 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lig1P37913 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lig1P37913 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms