Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpargP37238 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpargP37238 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpargP37238 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpargP37238 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpargP37238 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpargP37238 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpargP37238 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpargP37238 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpargP37238 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpargP37238 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpargP37238 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpargP37238 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpargP37238 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms