Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms