Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc5P35689 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ercc5P35689 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms