Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mmp12P34960 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms