Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms