Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc10P31257 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc10P31257 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc10P31257 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms