Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa2P31245 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxa2P31245 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa2P31245 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxa2P31245 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms