Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OatP29758 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OatP29758 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OatP29758 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OatP29758 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OatP29758 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OatP29758 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OatP29758 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
OatP29758 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OatP29758 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OatP29758 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OatP29758 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OatP29758 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OatP29758 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OatP29758 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OatP29758 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OatP29758 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OatP29758 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OatP29758 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OatP29758 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OatP29758 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OatP29758 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms