Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcdP28867 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms