Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RxraP28700 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RxraP28700 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RxraP28700 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RxraP28700 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RxraP28700 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RxraP28700 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RxraP28700 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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