Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gjb1P28230 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb1P28230 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms