Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vav1P27870 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vav1P27870 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms