Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xrcc5P27641 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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