Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgfb2P27090 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgfb2P27090 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms