Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CftrP26361 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CftrP26361 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CftrP26361 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CftrP26361 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CftrP26361 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CftrP26361 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CftrP26361 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CftrP26361 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CftrP26361 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CftrP26361 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CftrP26361 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CftrP26361 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CftrP26361 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CftrP26361 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CftrP26361 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CftrP26361 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CftrP26361 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CftrP26361 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CftrP26361 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CftrP26361 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CftrP26361 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CftrP26361 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms