Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna1P26231 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna1P26231 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnna1P26231 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms