Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk11bP24788 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk11bP24788 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms