Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfyaP23708 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfyaP23708 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfyaP23708 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms