Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZfaP23607 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZfaP23607 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZfaP23607 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms