Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ggta1P23336 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms