Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkchP23298 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkchP23298 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkchP23298 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkchP23298 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkchP23298 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkchP23298 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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