Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PparaP23204 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PparaP23204 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PparaP23204 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PparaP23204 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PparaP23204 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PparaP23204 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PparaP23204 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PparaP23204 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PparaP23204 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PparaP23204 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PparaP23204 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PparaP23204 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PparaP23204 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PparaP23204 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PparaP23204 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PparaP23204 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PparaP23204 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PparaP23204 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PparaP23204 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PparaP23204 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PparaP23204 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PparaP23204 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PparaP23204 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms