Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd3eP22646 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd3eP22646 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms