Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clk1P22518 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clk1P22518 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms