Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmnb2P21619 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmnb2P21619 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmnb2P21619 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms