Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxb9P20615 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb9P20615 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms