Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ms4a1P19437 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a1P19437 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms