Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnnc1P19123 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms