Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6ka3P18654 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps6ka3P18654 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps6ka3P18654 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms