Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18527 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P18527 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P18527 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18527 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18527 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18527 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18527 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms