Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Svs4P18419 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Svs4P18419 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms