Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph1P17532 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tph1P17532 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tph1P17532 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tph1P17532 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tph1P17532 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tph1P17532 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms